กองป้องกันและบรรเทาสาธารณภัย ให้มีผู้อำนวยการกองป้องกันและบรรเทาสาธารณภัย เป็นผู้บังคับบัญชาข้าราชการ ลูกจ้าง และพนักงานจ้าง โดยรับผิดชอบในการปฏิบัติราชการของกองป้องกันและบรรเทาสาธารณภัย แบ่งการบริหารงานออกเป็น 2 ฝ่าย ดังนี้
1.ฝ่ายป้องกันและบรรเทาสาธารณภัย
ปฏิบัติงานให้ความช่วยเหลือด้านกำลังพลและอุปกรณ์อันเกี่ยวเนื่องกับภัยพิบัติต่างๆ งานควบคุมการปฏิบัติงานเจ้าหน้าที่ศูนย์วิทยุสื่อสาร งานเร่งด่วนที่ได้รับความเดือดร้อนกับประชาชน เช่น อุทกภัย วาตภัย ที่ต้องดำเนินการก่อน งานด้านจิตอาสาทุกๆที่มีการพัฒนาเพื่อสังคมส่วนรวมและประชาชนทุกพื้นที่ในจังหวัดปทุมธานี งานป้องกันและบรรเทาสาธารณภัยทุกประเภท งานวิเคราะห์พื้นที่เสี่ยงเกิดเหตุสาธารณภัยทุกประเภท งานแผนการป้องกัน เฝ้าระวัง และแจ้งเตือนภัย งานแผนการระงับเหตุ งานศูนย์รับแจ้งเหตุงานรายงานผล ดําเนินงานตามแผนงานด้านต่างๆ งานสํารวจแหล่งธรรมชาติ และจุดติดตั้งหัวรับน้ำดับเพลิง งานจัดตั้งกลุ่มอาสาสมัครบรรเทาสาธารณภัยงานฝึกอบรมและฝึกซ้อมตามแผนการป้องกันและบรรเทาสาธารณภัย งานประชาสัมพันธ์เผยแพร่ให้ความรู้การป้องกันสาธารณภัยต่างๆ แก่ ชุมชน ส่วนราชการ โรงเรียน สถานประกอบการต่าง ๆ งานตรวจสอบยานพาหนะ เรือดับเพลิง ปริมาณน้ำดับเพลิง สารเคมีดับเพลิง และวัสดุอุปกรณ์ต่างๆ งานจัดทำทะเบียนประวัติการใช้ยานพาหนะ เรือดับเพลิง สารเคมีดับเพลิง งานแผนการบำรุงรักษายานพาหนะ สารเคมีดับเพลิงงานจัดทำทะเบียนควบคุมการจัดซื้อ เก็บรักษา การเบิกจ่ายวัสดุ อุปกรณ์ อะไหล่ น้ำมันเชื้อเพลิง งานจัดทำและเก็บรวบรวมข้อมูลสถิติด้านสาธารณภัย งานจัดตั้งศูนย์ปฏิบัติการฯและศูนย์เฉพาะกิจฯ จัดตั้งเครือข่ายระบบสื่อสาร ประสานส่วนราชการ โรงพยาบาล กู้ภัยต่างๆ ในการสนับสนุนช่วยเหลือประชาชนที่ประสบภัย งานอื่น ๆ ที่เกี่ยวข้องและที่ได้รับมอบหมาย
2. ฝ่ายสงเคราะห์และฟื้นฟูผู้ประสบภัย
งานแผนการช่วยเหลือผู้ประสบภัยเร่งด่วน เช่น ที่พักอาศัย เครื่องนุ่งห่ม อาหาร เครื่องดื่ม ยารักษาโรค งานจัดทำทะเบียนผู้ประสบภัย งานสงเคราะห์ผู้ประสบภัย งานปฐมพยาบาลเบื้องต้น งานแผนการฟื้นฟูและการสงเคราะห์ผู้ประสบภัย งานจัดหาเครื่องอุปโภค บริโภค พัสดุช่วยเหลือผู้ประสบภัย งานบูรณะสิ่งก่อสร้างสาธารณประโยชน์ งานสำรวจ ตรวจสอบ สภาพเสียหายเบื้องต้น งานสนับสนุนและประสานงานกับหน่วยงานอื่นที่เกี่ยวข้อง งานสนับสนุนน้ำเพื่อการอุปโภค บริโภค และการเกษตร งานส่งเสริมสนับสนุนด้านทรัพยากรธรรมชาติและ สิ่งแวดล้อม งานบริการข้อมูล สถิติ ช่วยเหลือให้คำแนะนําทางวิชาการ งานปฏิบัติงานทั่วไป งานสารบรรณ งานงบประมาณ งานการเงินและบัญชี งานพัสดุ ตลอดจนงานรับเรื่องราวร้องทุก งานประสานการปฏิบัติงานกับท้องถิ่น เครือข่ายอาสาสมัครและหน่วยงานต่างๆภายในจังหวัดเพื่อบูรณาการร่วม งานจัดทำโครงการฝึกอบรมเพื่อพัฒนาศักยภาพของอาสาสมัครในรูปแบบต่างๆ งานอื่น ๆ ที่เกี่ยวข้องและที่ได้รับมอบหมาย