5. กองสาธารณสุข ให้มีผู้อำนวยการกองสาธารณสุข เป็นผู้บังคับบัญชาข้าราชการ ลูกจ้าง และพนักงานจ้าง โดยรับผิดชอบในการปฏิบัติราชการของกองสาธารณสุข แบ่งการบริหารงานออกเป็น 4 ฝ่าย ดังนี้
5.1 ฝ่ายบริหารงานสาธารณสุข มีหน้าที่ความรับผิดชอบเกี่ยวกับ งานการศึกษา ค้นคว้า วิจัย วิเคราะห์และจัดทําแผนงานด้านสาธารณสุข งานคุ้มครองผู้บริโภค งานบริหารสาธารณสุขงานหลักประกันสุขภาพงานมาตรฐานและคุณภาพหน่วยบริการงานยุทธศาสตร์สาธารณสุข งานกฎหมาย สาธารณสุข งานบริการรักษาความสะอาด งานบริการข้อมูล สถิติ ช่วยเหลือให้คําแนะนําทางวิชาการงานให้บริการด้านสาธารณสุข งานเภสัชกรรม งานพยาธิวิทยา งานรังสีวิทยา งานวิชาการทางการแพทย์งานวิเคราะห์ทางวิทยาศาสตร์ งานการแพทย์ งานการแพทย์ ฉุกเฉิน งานรักษาพยาบาล งานศูนย์บริการสาธารณสุข งานโรงพยาบาลส่งเสริมสุขภาพตําบล งานแพทย์แผนไทย งานส่งเสริมสนับสนุนการแพทย์ แผนไทย งานกายภาพและอาชีวบําบัด งานฟื้นฟูสมรรถภาพและจิตใจผู้ป่วย งานทันตสาธารณสุข งานป้องกันและบําบัดการติดสารเสพติด งานสัตวแพทย์ งานอื่นๆ ที่เกี่ยวข้องและที่ได้รับมอบหมาย
5.2 ฝ่ายส่งเสริมสุขภาพ มีหน้าที่ความรับผิดชอบเกี่ยวกับ งานส่งเสริม สนับสนุน การพัฒนาคุณภาพชีวิตเด็ก สตรี ผู้สูงอายุ ผู้พิการ และผู้ด้อยโอกาส งานส่งเสริมสุขภาพ งานสุขาภิบาล ในสถานประกอบการ งานเวชปฏิบัติครอบครัวงานสุขาภิบาลชุมชน งานอื่นๆ ที่เกี่ยวข้องและที่ได้รับมอบหมาย
5.3 ฝ่ายป้องกันและควบคุมโรค มีหน้าที่ความรับผิดชอบเกี่ยวกับ งานส่งเสริมป้องกันควบคุมโรค งานป้องกันเฝ้าระวังและควบคุมโรคติดต่อและโรคไม่ติดต่อ งานบริหารงานทั่วไปของ กองสาธารณสุข งานธุรการของกองสาธารณสุข งานสารบรรณของกองสาธารณสุข งานอื่นๆ ที่เกี่ยวข้องและ ที่ได้รับมอบหมาย
5.4 ฝ่ายส่งเสริมสิ่งแวดล้อม มีหน้าที่ความรับผิดชอบเกี่ยวกับ งานอนามัยสิ่งแวดล้อม งานบริการและพัฒนาระบบจัดการมูลฝอย งานบริหารจัดการสิ่งปฏิกูล งานศึกษา ค้นคว้า วิเคราะห์ วิจัย กําหนด มาตรการและแผนดําเนินงานด้านสิ่งแวดล้อม การประเมินผลกระทบด้านสิ่งแวดล้อม การเฝ้าระวังและตรวจสอบคุณภาพสิ่งแวดล้อม งานส่งเสริมสนับสนุนด้านสิ่งแวดล้อม งานจัดทําและพัฒนาระบบฐานข้อมูลการจัดการสิ่งแวดล้อม งานรณรงค์และการฝึกอบรมสร้างจิตสํานึกด้านสิ่งแวดล้อม งานวางแผนและจัดทําแผนดําเนินงานด้านการเฝ้าระวัง ควบคุม มลพิษทางน้ำ อากาศ และเสียง งานเฝ้าระวัง บําบัด ตรวจสอบคุณภาพน้ำ อากาศ ของเสีย และสารอันตรายต่างๆ งานอื่นๆ ที่เกี่ยวข้องและที่ได้รับมอบหมาย